保留区中重要的内容有两部分，一部分是主引导区域，另一部分是备份引导区域。主引导区域占用0~11号扇区，备份引导区域占用12~23号扇区，这部分完全是0~11号扇区的完整备份。23号扇区至FAT表前一个扇区，是未使用部分。

主引导区域包括的0~11号扇区，共有12个扇区，可分为5个子区域：主引导扇区；主扩展引导扇区；OEM参数区；保留扇区；校验扇区。

引导扇区之后的1~8号扇区，也被称为扩展引导扇区，通常情况下这8个扇区除每个扇区的结尾写入“55AA”外，其他字节全部为零。当有较大的引导程序，超出了引导扇区所能容纳的字节数时。就会使用这部分扩展引导扇区的空间进行存储。

9号扇区，据称用于OEM参数记录，实验过程中发现格式化时该扇区不进行改动。

10号扇区没有特定用途，作为保留扇区。试验时发现该扇区在格式化过程中会被清零。

11号扇区是一个存放校验信息的扇区，用于存放前11个扇区的校验值。如果人为更改某些信息，就必须重新正确计算出新的校验值才可以。